古生物学者断定恐龙饮食的另一证据便是齿痕。在恐龙骨骼化石中所发现的多数凹槽或刺孔，都是受肉食性恐龙攻击的结果。但多数情况下，齿痕不能表示出该受害者是被主动捕食，还是在死后才被吃掉。而且除了特殊情况，捕食者的身份也难以明确。
鸭嘴龙，如这只冠龙（Corythosaur），拥有特殊的牙齿和嘴巴来磨碎植物。（Big Stock Photo）
一个例子是，在一只草食性迷惑龙（Apatosaurus）骨头上发现的刻痕距离与一只肉食性异特龙（Allosaurus）牙齿间的距离相吻合。另一种例子是，在一只草食性三角龙（Triceratops）的骨盆上与一只草食性埃德蒙顿龙（Edmontosaurus）的趾骨上发现的咬痕，用牙用油灰制作咬痕模具后，恰与一只肉食性暴龙的牙齿化石相匹配。还有一个极其少见的例子是，在一只草食性鸭嘴龙的腓骨中卡着一颗霸王龙的牙齿。当然最明显的情形（也是最少见的）是两只动物的骨头、牙齿化石在殊死搏斗中锁在一起，这种情形下可以辨别出捕食者。