真菌与高等植物根系之间的共生联合体，对两者均有益。在一些菌根中，真菌菌丝侵入根细胞的间隙形成根鞘;在另一些菌根中，真菌生活在根细胞内部和根细胞之间。植物因真菌的存在而更有效地吸收营养，而真菌从植物那里获得碳水化合物及其他养分。禾草和担子菌之间形成的某些菌根联合体能在土表产生伞菌的“仙人圈”。