吃蜥脚类恐龙的披羽蛇翼龙
许多翼龙以鱼为食，它们长有锋利的牙齿，是技能高超的捕鱼能手。那些没牙的翼龙呢？它们同样可以像今天的海鸥一样捕食鱼类。这些翼龙会在掠过水面的时候，张开上下颌，在接触水面的一瞬间把头钻到水下，准确地咬住靠近水面活动的鱼类。人们在极少的翼龙标本的胃部发现了尚未消化完的鱼类骨骼，也在翼龙的粪便中发现鱼类骨骼碎片，这些是翼龙以鱼类为食的最直接证据。
吃软体动物的准噶尔翼龙
当然，也有一些翼龙以昆虫为食，其中，蛙嘴翼龙是捕虫大王。蛙嘴翼龙的脑袋短而宽，就像青蛙的嘴一样，这样就利于在空中飞行时捕食昆虫。体形非常娇小的森林翼龙也可以灵巧地飞行于树林和灌木丛中，以捕食昆虫为生。还有一群更加特别的梳颌翼龙，牙齿细长且数目众多，它们的捕食行为就像今天的琵鹭一样，靠过滤水中细小的浮游生物和虫子为生，发现于阿根廷的南方翼龙就是它们中最典型的代表。
掠海翼龙捕食鱼类示意图
有些翼龙还有更奇特的捕食行为。准噶尔翼龙前端无牙并向上弯曲的嘴和后部的牙齿就是一套进食软体动物的最佳餐具。披羽蛇翼龙可能以食腐为生，或者靠挖掘泥沙下面的动物为食。最近的研究表明，它们在陆地上行走也非常灵活，这些像长颈鹿一样高的翼龙也可能会以地面上的其他爬行动物为食，甚至对幼小的霸王龙或蜥脚类恐龙也敢下手。那么有没有以植物种子为食的翼龙？虽然目前还没有发现胃部保存种子的翼龙化石，但是依据翼龙的上下颌结构，科学家认为发现于巴西、中国的古神翼龙和中国翼龙可能以采食种子或果实为食。甚至有人推测，采食种子或果实的翼龙与早期被子植物之间具有协同演化的关系，这些翼龙对种子的传播可能促进了白垩纪被子植物的繁盛。此外，一些翼龙可能是杂食性的，在不同的时期吃不同的食物。（汪筱林 孟溪 蒋顺兴 程心）